Этот каталог содержит списки пакетов, копируемые из метапрофиля в создаваемый профиль по необходимости (определяется по наличию имён списков в переменных *_LISTS, см. реализацию в Makefile). Список .base является особенным (формирует базовую систему, см. http://www.altlinux.org/Alterator-pkg) и копируется безусловно. Это предполагается изменить в будущем -- возможно, генерацией .base по тегам. Подкаталог tagged/ стоит рассматривать как экспериментальный, хотя весь необходимый код уже на месте -- см. bin/tags2lists и distro.mk (в корневом каталоге).